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RNA熒光原位雜交

將核酸探針的某一種核苷酸標(biāo)記上報告分子如生物素或直接標(biāo)記熒光素,可利用該報告分子與熒光素標(biāo)記的特異親和素之間的免疫化學(xué)反應(yīng)或直接經(jīng)熒光檢測體系在鏡下對待測核酸(mRNA、lncRNA、circRNA、miRNA)進(jìn)行定性、半定量或相對定位分析的一種實驗方法。

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實驗介紹

【技術(shù)原理】

        RNA-FISH原理:如果待檢測的細(xì)胞或組織切片上的靶核酸與所用的核酸探針是同源互補的,二者經(jīng)‘’變性-退火-復(fù)性‘’,即可形成靶核酸與核酸探針的雜交體。將核酸探針的某一種核苷酸標(biāo)記上報告分子如生物素或直接標(biāo)記熒光素,可利用該報告分子與熒光素標(biāo)記的特異親和素之間的免疫化學(xué)反應(yīng)或直接經(jīng)熒光檢測體系在鏡下對待測核酸(mRNA、lncRNA、circRNA、miRNA)進(jìn)行定性、半定量或相對定位分析的一種實驗方法。


【實驗流程】


原位雜交.png

案例展示

1591342997501883.png熒光原位雜交.jpg


細(xì)胞的circRNA熒光原位雜交

注意事項

1、烤好的組織切片需經(jīng)過脫蠟處理,二甲苯脫蠟不足會導(dǎo)致探針雜交強(qiáng)度和雜交效率降低、熒光背景高等,影響實驗結(jié)果??筛鶕?jù)實際情況延長脫蠟時間。

2、酶消化注意事項:

酶的濃度過高、消化時間過長或孵育溫度過高,會對細(xì)胞的結(jié)構(gòu)有一定的破壞,細(xì)胞核消失或細(xì)胞核辨認(rèn)不清,也會造成一定程度的組織脫片;

酶消化不足會造成蛋白消化不透徹,降低組織的通透性以及雜交信號的強(qiáng)度和雜交率;

消化酶均為現(xiàn)用現(xiàn)配。

3、由于熒光原位雜交探針雜交的區(qū)段長,在組織或細(xì)胞塊切片中,可能出現(xiàn)人為的信號異常,如缺失、分離等。

送檢與交付標(biāo)準(zhǔn)


樣品類型樣品需求保存條件運輸條件備注
新鮮組織新鮮取材組織,用 PBS 清洗干凈血液等,立即-80℃保存-80℃干冰所有樣本均須有唯一標(biāo)記,且標(biāo)記清晰可識
一般固定組織一般組織體積不超過2cmX2cmX0.5cm,固定時盡量保持組織的原有形態(tài)并清理干凈血液及多余部分,如腸道內(nèi)容物;固定液體積為組織大小的10倍以上,容器足夠容納組織不使其擠壓變形。標(biāo)注好固定液類型和固定時長常溫常溫
特殊固定組織睪丸、眼球、脊髓、肌肉等組織:推薦使用對應(yīng)的特殊固定液進(jìn)行固定,以保證固定效果。如Bouin液,適用于睪丸組織、皮膚組織及眼球的固定

組織蠟塊組織由標(biāo)準(zhǔn)的石蠟包埋盒包埋(尺寸為30*24*7mm),石蠟與組織要均勻接合,不能有裂痕;蠟塊厚度根據(jù)所需切片的數(shù)量而定,有效厚度至少要超過 0.1cm。盡量提供半年內(nèi)的組織蠟塊,超過半年的蠟塊抗原可能丟失,做免疫組化可能出現(xiàn)檢測不到蛋白。常溫常溫
組織切片需用防脫載玻片進(jìn)行撈片,并注明切片厚度、已烤片溫度與時間,組織應(yīng)在靠近切片下端 1/3 處。4℃冰袋
細(xì)胞爬片使用 12 孔板或 24 孔板專用細(xì)胞爬片,細(xì)胞爬片經(jīng)固定后用 PBS 洗滌 2~3 次,保存在 PBS 中,用封口膜密封孔板。每個爬片在孔板蓋上應(yīng)有唯一的標(biāo)記,并有電子版的分組信息,以防標(biāo)記在運輸途中模糊。常溫常溫
植物樣本新鮮組織FAA固定,木質(zhì)化程度不高;對于較薄的葉片,如果要求平行葉片切片,難以保證切完整;根莖要求直徑>1mm常溫常溫
抗體保存抗體的抗體管上應(yīng)有能夠識別此抗體的標(biāo)記,并附帶說明書,抗體的量應(yīng)大于實驗所需的量。組織切片、組織芯片按稀釋后 100μl 一張切片計算抗體用量, 24 孔板細(xì)胞爬片圓形蓋玻片按稀釋后 200μl 一張計算抗體用量,12 孔板細(xì)胞爬片圓形蓋玻片按稀釋后 400μl 一張計算抗體用量。-20℃冰袋或干冰




病理交付標(biāo)準(zhǔn).jpg

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